La revue «Gut Microbes» a publié un article de synthèse intitulé «Why probiotics fail: gut niche tension as the missing variable?», rédigé par une équipe de scientifiques comprenant Nadezhda Pechnikova, jeune chercheuse à l'Institut.
Ces travaux abordent le problème de l'imprévisibilité des probiotiques: lors des essais cliniques, ils aident certains patients et sont inefficaces chez d'autres. Les auteurs attribuent ce phénomène à l'état écologique de l'intestin au moment de l'administration et introduisent le concept de « tension de la niche microbienne », désignant l'équilibre des forces qui entravent ou, au contraire, favorisent l'implantation de la souche introduite. Pour fournir une évaluation quantitative, l'indice de tension de niche (NTI) a été proposé; il peut être calculé à partir de la composition du microbiote, du métabolisme, du pH, du temps de transit et d'autres paramètres.
Le rôle du sexe et du statut hormonal est particulièrement mis en avant: ces facteurs influencent significativement la stabilité des bactéries intestinales, mais sont presque totalement négligés dans la recherche sur les probiotiques.
Les auteurs proposent des implications pratiques: préparer la niche écologique au moyen du régime alimentaire et de prébiotiques, sélectionner des souches adaptées au patient spécifique, et recourir à des consortiums coopératifs ainsi qu'à des modèles prédictifs. Toutefois, le concept lui-même demeure une hypothèse de travail nécessitant une validation prospective.